Medicinregularitet for kronisk nyresvigt og underliggende mekanisme baseret på data mining, netværksfarmakologi og molekylær docking Ⅱ

Jan 04, 2023

2.6 CRF-målscreening Ved at søge i GeneCards og OMIM-databaser for at opnå CRF-terapeutiske mål, sætte Relevancescore større end eller lig med 5 og slette duplikerede mål, blev der opnået i alt 795 mål.

Cistance Chronic Renal Failure

 
Spørg mere:
wallence.suen@wecistanche.com 0015292862950

Cistance Chronic Renal Failure

Fig. 1 Narkotikaforeningsnetværk under betingelse af støtte 60 og tillid 0. 85
2.7 Fælles målscreenings- og interaktionsnetværkskonstruktion 795 CRF-mål og 80 lægemiddelaktive ingredienshandlingsmål blev screenet ud med R-sprog-software og Perl-sprogprogram for at screene fælles mål, i alt 37 blev indlæst i Venny 2.1-software, og den opnåede Wei ENTU Se Forbedret Publication Supplement

Cistance Chronic Renal Failure


STRING blev brugt til at indtaste 37 fælles mål, og protein-protein-interaktioner (PPI'er) blev konstrueret i "high confidence: 0.4"-tilstand, se Enhanced Publication Supplementary Material. Anvend plug-in'et count.R for at tælle de 30 bedste proteinmål med forekomsthyppighed, blandt hvilke IL-6, VEGFA, Caspase-3, NOS3, HIF-1 osv. vises mere ofte.

Cistance Chronic Renal Failure

2.8 Konstruktion af biomolekylært netværk Brug af Cytoscape 3.7.1 i aktiv ingrediens-CRF-mål PPI netværksdiagram. Blandt dem repræsenterer rød sygdom, lilla repræsenterer Xinfang 1, blå repræsenterer den aktive ingrediens, og grøn repræsenterer det fælles mål for Xinfang 1 aktiv ingrediens og CRF. Se ekstramateriale til udvidet publikation.

Tabel 4 Korrelationsanalyse mellem lægemidler baseret på metoden til forbedret gensidig information

Cistance Chronic Renal Failure

2.9 GO-analyse og kerneforløbsscreening Histogrammerne og boblediagrammerne opnået fra GO-funktionsanalysen af ​​ovenstående almindelige mål ved hjælp af R-sprogsoftware er vist i det supplerende materiale til Enhanced Publication. De biologiske processer involverer hovedsageligt steroidbinding, steroidhormonreceptoraktivitet, nuklear receptoraktivitet, transkriptionsfaktoraktivitet osv. Det foreslås, at den nye formel 1 kan behandle CRF ved at regulere flere komplekse biologiske processer. Analyse af KEGG Pathway berigelse af målene for Xinfang 1, hovedfordelingen af ​​33 fælles mål
I lipid og åreforkalkning, nuklear transkriptionsfaktor-KB (NF-KB), Toll-lignende receptor (TLR), HIF-1 og andre veje viser det, at Xinfang 1 synergistisk behandler CRF ved at virke på flere veje.

Tabel 5 Nye ordinationer til behandling af CRF baseret på entropi hierarkisk clustering

Cistance Chronic Renal Failure

2.10 Molekylær docking Hvis bindingsenergien er Mindre end eller lig med -4 kJ·mol-1, betyder det, at molekylet har en god bindingsevne til målet. De fem hovedkomponenter kan godt kombineres med målproteinet. Blandt dem har stigmasterol den bedste kombination med NOS3. Resultaterne viste, at disse 5 hovedkomponenter interagerede med proteinmålet og var stabile efter binding. Se tabel 7.

Cistance Chronic Renal Failure

2.10 Molekylær docking Hvis bindingsenergien er Mindre end eller lig med -4 kJ·mol-1, betyder det, at molekylet har en god bindingsevne til målet. De fem hovedkomponenter kan godt kombineres med målproteinet. Blandt dem har stigmasterol den bedste kombination med NOS3. Resultaterne viste, at disse 5 hovedkomponenter interagerede med proteinmålet og var stabile efter binding. Se tabel 7.

Tabel 7 Docking af hovedkomponenter med de tilsvarende nøglemålmolekyler af ny recept 1

Cistance Chronic Renal Failure

2.11 Effekt af ny formel 1 på NOS3-ekspression i CRF-rotter
2.11.1 Virkninger på serum-kreatinin og urea-nitrogen Serum-kreatinin og urea-nitrogen (Hitachi H7600 automatisk biokemisk analysator, kreatinin- og urea-assay-kit) i modelgruppen var signifikant øget sammenlignet med den tomme gruppe (P<0.05), and the new formula 1 was given for treatment After treatment, serum creatinine and blood urea nitrogen were significantly lower than those in the model group (P<0.05). The results are shown in Table 8.
Tabel 8 Virkning af serumkreatinin og urinstofnitrogen af ​​ny recept 1(xˉ±s,n=10)

Cistance Chronic Renal Failure

Tabel 8 Virkning af serumkreatinin og urinstofnitrogen af ​​ny recept 1(xˉ±s,n=10)

Cistance Chronic Renal Failure

2.11 Effekt af ny formel 1 på NOS3-ekspression i CRF-rotter
2.11.1 Virkninger på serum-kreatinin og urea-nitrogen Serum-kreatinin og urea-nitrogen (Hitachi H7600 automatisk biokemisk analysator, kreatinin- og urea-assay-kit) i modelgruppen var signifikant øget sammenlignet med den tomme gruppe (P<0.05), and the new formula 1 was given for treatment After treatment, serum creatinine and blood urea nitrogen were significantly lower than those in the model group (P<0.05). The results are shown in Table 8.
 

2.11.2 Effekter på NO- og NOS3-indhold inyrevævNO- og NOS3-indholdet i modelgruppen var signifikant lavere end dem i den normale gruppe (P<0.05). After treatment with the new recipe 1, the NO and NOS3 contents were significantly higher than those in the model group (P<0.05) . The results are shown in Table 9.

3 Diskussion
3.1 Data mining-analyse I denne undersøgelse blev det traditionelle kinesiske medicin arvehjælpesystem brugt til at analysere direktør Wu Zhaodongs medicineringsregler i behandlingen af ​​CRF. Gennem analysen af ​​korrelationsalgoritmen blev det uddraget, at direktør Wu Zhaodongs almindeligt anvendte lægemidler til behandling af CRF omfatter astragalus, liuyuexue, smilax smilax, stegt Atractylodes macrocephala, igle, Shiwei, angelica, eupatorium, akyranthes bidentata og alisma. Baseret på analysen af ​​reglerne for receptpligtig medicin baseret på foreningens regler, viser det sig, at de almindeligt anvendte lægemiddelkombinationer er: ① Smilax,Cistancheog Junexue; ② Astragalus,Cistancheog Junexue; ③ Smilax,Astragalus; Sne; ⑤ Astragalus, stegt Atractylodes macrocephala; ⑥ Omrørt Atractylodes macrocephala, Liuyuexue; De nye recepter til behandling af CRF baseret på entropi hierarkisk clustering omfatter: ①bitter mandel-astragalus-klokkeblomst-danggui-smilax-stegt Atractylodes macrocephala; Loquat bladbrændt ephedra; ④Su stam-codonopsis-coptidis-heterophylla heterophylla; diarré; ⑦Scutellaria baicalensis-igle-rød pæon rod-loquat blade-Adenophora;
Direktør Wu Zhaodong mener, at CRF mestinvolverer milten og nyren, og patogenesen er opdelt i mangel og overskud. Demangelsyndrom er hovedsageligt forårsaget af mangel på milt og nyre, og behandlingen er at puste nyt liv imilt og nyre. Fremme af fugt, harmonisering af netværk og udelukke uklarhed osv. Astragalus, Angelica og Wok Atractylodes Rhizom bruges mest til at genopbygge qi og blod; igle, eupatorium og akyranthes bidentata bruges mest som lægemidler til at fremme blodcirkulationen og fjerne blodstase; .

 

3.2 Potentiel virkningsmekanisme for New Prescription 1 New Prescription 1 er sammensat af astragalus, angelica, stegt Atractylodes macrocephala, Smilax cocos, bitter mandel og klokkeblomst. I recepten er Astragalus membranaceus sød i smagen og let varm af natur, og den hører til milt- og lungemeridianen.

 

Cistanche can treat chronic kidney disease

 

 

Fugt og andre effekter, det kan helbrede CRF Sanjiao Shishi [10], det er monark-lægemidlet; Angelica er sød og stikkende, varm af natur, vender tilbage til hjerte-, lever- og miltmeridianen, har den funktion at fremme blodcirkulationen og er ministerstoffet.

Astragalus, angelica, monark og minister-kompatibilitet, nærende qi og blod, kan signifikant reducere urinprotein, hæmme nyrefibrose og øge erythropoietinindholdet [11]. Omrørt Atractylodes macrocephala er sød i smagen, bitter i naturen og varm i naturen. Den hører til miltmeridianen og mavemeridianen. Regulerer tarmens mikroøkologi, hæmmer endotoksin,
Spil immunmodulerende effekt [13], og som et hjælpestof. Astragalus, Angelica, Cistanche og Atractylodesmakrocephala er hovedkombinationernetil næring til milten, nyrerne og blodet[14. Smilax tuckahoe er sød og let i smagen, flad af natur og hører til lever- og mavemeridianen. I alt adjuverende medicin. Bitter mandel og Platycodon grandiflorum er medicinpar. Bitter mandel undertrykker og sænker sig, Platycodon grandiflorum stiger og stiger. En stiger op og en ned, udjævner Qi-bevægelser, regulerer vandkanaler, diurese og reducerer hævelse og fjerner uklarhed for slim [16]. Direktør Wu Zhaodong mener, at hos patienter med CRF falder turbiditeten og giften ikke, og den op- og nedadgående bevægelse af visceral qi er blokeret. Metoden til at "løfte gryden og afdække" bruges ofte til at genoprette qi-bevægelsen, hvilket er befordrende for udledning af ond turbiditet, stasis og toksin.
For at udforske den potentielle mekanisme af den nye recept 1 i behandlingen af ​​CRF, blev netværksfarmakologisk forudsigelse, molekylær docking og eksperimentel verifikation yderligere udført. Resultaterne viste, at 28 bioaktive komponenter i New Formel 1 blev screenet ud, og de vigtigste aktive komponenter var -sitosterol, stigmasterol, quercetin, isorhamna Su, kaempferol. Baseret på det aktive ingrediens-CRF-målinteraktionsnetværk blev nøglemål som IL-6, VEGFA, Caspase-3, NOS3 og HIF-1 opdaget. -sitosterol kan reducere det totale kolesterolniveau i serum og derved hæmme nyreskade [17]. -sitosterol kan hæmme M1-polariseringen af ​​makrofager, øge M2-polariseringen, reducere niveauerne af TNF- og IL-6 og hæmme TLR for at regulere immunitet [18]. Stigmasterol er et naturligt steroid, der hæmmer LPS/TLR-vejen for at forbedre systemisk inflammatorisk respons [19], regulerer TNF-/VEGFR-aksen og hæmmer angiogenese [20]. Isorhamnetin hæmmer fibrose ved at hæmme ekstracellulær matrixdannelse ved at virke på TGF- 1/Smad3- og TGF- 1/p38 MAPK-veje [21]. Kaempferol kan signifikant reducere oxidativt stress og lipidperoxidation ved at hæmme ASK1/MAPK-vejen [22]; hæmmer frigivelsen af ​​inflammatoriske faktorer gennem NF-KB-signalvejen [23].

IL-6 deltager i processen med immunbetændelse og nyrefibrose ved at aktivere JAK/STAT, Ras-Raf MAP og andre veje under højt glukosemiljø[24]. VEGFA er en undertype af VEGF, og kombinationen af ​​VEGFA og VEGFR2 kan forværre nyre interstitiel fibrose[25]. Caspase-3 medierer ekspressionen af ​​GSDME i CRF renale tubulære celler for at forårsage sekundær nekrose og fibrose [26]. Renal epidermal vækstfaktorreceptor kan mediere podocytautofagi og inflammatorisk infiltration[27]
. NOS3 kan reducere niveauet af SOD, udøve antioxidations- og antiinflammatoriske virkninger[25]. Dyreforsøg fandt også, at efter behandling med New Formula 1 var niveauerne af NO og NOS3 signifikant højere end dem i modelgruppen, hvilket tyder på, at New Formula 1 kan udøve antioxidant- og antiinflammatoriske virkninger ved at virke på NOS3.

 

Kombineret med KEGG-databasen til pathway-annotationsanalyse, blev det fundet, at de aktive ingredienser i Xinfang 1 kan virke på lipider og åreforkalkning, NF-KB, TLR, HIF-1 og andre veje. Lipid og åreforkalkning er de vigtigste faktorer ved CRF kombineret med kardiovaskulær risiko[28]; NF-κB pathway aktiverer inflammatorisk respons og deltager i progressionen af ​​CRF[29]; TLRmedierer medfødt immunrespons, medierer betændelse og nyreskadeognyrefibrose[30]; HIF-1 regulerer nyrens iltsansning, hvilket fører til renal hypoxi og interstitiel fibrose, som er nøglen til behandlingen af ​​CRF[31].

effect of cistanche improve kidney function (2)

Sammenfattende kan New Formel 1 virke på IL-6, VEGFA, Caspase-3, NOS3, HIF-1 og andre mål gennem -sitosterol, stigmasterol, quercetin, isorhamnetin, kaempferol og andre komponenter . Regulerer lipid og åreforkalkning, NF-κB, TTLR, HIF-1 og andre veje, spiller flere roller
CRF kan behandles ved at integrere regulatoriske effekter i flere punkter, flere mål, flere veje og flere links. Molekylær docking bekræftede også, at der er en stærk bindingsaktivitet mellem de ovennævnte komponenter og målet.

3.3 Resumé Direktør Wu Zhaodongs behandling af CRF fokuserer hovedsageligt på at nære milten og nyrerne, nære qi og blod, ophæve blokeringen af ​​qi og frigøre uklarhed fra sikkerhedsstillelserne. Baseret på TCM Inheritance Auxiliary System Platform udførte denne undersøgelse datamining-forskning i direktør Wu Zhaodongs medicinregler og opnåede ny viden og ny information, der ikke blev opnået fra traditionel medicinsk case-sammenstilling og statistisk forskning, og gav nyttig information til direktør Wu Zhaodongs dybdegående udgravning og arv af CRF-behandlingserfaring. henvise til.
Gennem netværksfarmakologi blev det fundet, at effekten af ​​Xinfang 1 til behandling af CRF er multikomponent og multi-target, og den er hovedsageligt involveret i reguleringen af ​​lipider og åreforkalkning, NF-κB, Toll-lignende receptorer, HIF{{ 5}} og andre veje til at hæmme CRF-fremskridt. Den nye formel 1 er blevet undersøgt teoretisk og eksperimentelt
Virkningsmekanismen i behandlingen af ​​CRF er en værdifuld reference for traditionel kinesisk medicin til behandling af CRF. Receptreglerne, kernekombinationerne og nye recepter opnået ved at anvende foreningsregler og klyngeforskning har dog stadig brug for yderligere klinisk verifikation.

Du kan også lide