En rolle for BATF3 i Tu9-differentiering og T-celle-drevne L-patologier MucOsal (del 2)

For mere information kontakt venligstdavid.wan@wecistanche.com

DISKUSSION

T#9-celler er vigtige for udviklingen af ​​inflammatoriske og allergiske sygdomme. Det transkriptionelle program og de inflammatoriske triggere, der driver differentieringen af ​​TH9-celler, er dog stadig ufuldstændigt forstået. I denne undersøgelse identificerede vi det pro-inflammatoriske cytokin TL1A som en potent inducer af murin og human T-9-differentiering og identificerede BATF3 som en vigtig transkriptionsfaktor involveret i differentieringen af ​​TH9-celler. Det transkriptionelle netværk, der blev induceret af TL1A, inkluderede transkriptionsfaktorerne BATF og BATF3 og flere BATF-regulerede gener (Supplerende figur 7). In vivo, i adoptive overførselseksperimenter,Tμ9-TL1A-cellervar stærkt pro-inflammatoriske, hvilket førte til tarm- og lungebetændelse. Den pro-inflammatoriske tilbøjelighed af T-9-TL1A-celler var afhængig af IL-9-produktion. Overførsler af Batf3-/T- og 9-TL1A-celler resulterede i reduceret slimhindebetændelse og cytokinekspression in vivo.

Selvom Tμ9-celler er blevet identificeret som en særskilt T-hjælper-undergruppe, er en transkriptionsfaktor, der fungerer som en masterregulator eller udelukkende identificerer TH9-fænotypen, ikke blevet identificeret. I stedet virker adskillige transkriptionsfaktorer sammen om at regulere differentieringen af ​​T-9-celler. BATF har vist sig at samarbejde funktionelt med IRF4 og at binde til sammensatte elementer inden for promotorregionerne af responsive gener. BATF sammen med IRF4 er blevet for nylig foreslået som "pionerfaktorer" i differentieringen af ​​Tp17-celler ved at bidrage til den oprindelige kromatintilgængelighed og lette adgangen til andre transkriptionsfaktorer.36 Vi observerede, at TL1A har en direkte effekt på BATF-ekspression, og det synergerer med TGF{{9} } og IL-4 for maksimalt at inducere BATF-ekspression, særligt tidligt i TH9-differentiering. Til støtte for denne opfattelse fører stimulering med TL1A alene til binding af BATF til II9-promotoren, mens den ikke har nogen direkte effekt på bindingen af ​​andre transkriptionsfaktorer (IRF4 og BATF3). Imidlertid,TH9-TL1Abetingelser forstærker synergistisk bindingen af ​​BATF3 og IRF4, såvel som acetylering af histon H3, en permissiv kromatinmodifikation, der korrelerer med ll9-promotoraktivitet.14 I overensstemmelse med tidligere offentliggjorte data er BATF påkrævet til ekspression af IL-9 og IL-10 under T,9-betingelser.15 TL1A er i det mindste delvist i stand til at overvinde kravet om BATF i induktionen af ​​IL-9 og IL-13 sandsynligvis gennem forbedring af anden transkription faktorer, der kan kompensere for tabet af BATF. En kandidat til funktionel kompensation er BATF3, som er transkriptionelt induceret af TL1A. Det er blevet foreslået, at BATF og BATF3 er funktionelt udskiftelige for Tu17- og Tp2-udvikling og overekspression af BATF3 i BATF-'- T-celler kan genoprette IL-17-produktion i TH17-celler og IL-4 og IL{{ 23}} produktion i T#2-celler.18323738 Imidlertid er BATF3's rolle i udviklingen af ​​Tu-celler under fysiologiske forhold og potentiel interaktion mellem BATF og BATF3 under TH9-differentiering ikke blevet defineret. Vi viser her, at TL1A letter bindingen af ​​BATF3 til ll9-promotoren. Som en funktionel konsekvens bidrager BATF3 til IL-9-produktion under T-9-betingelser, især i forbindelse med TL1A-stimulering. Overraskende nok er BATF3 uundværlig til tidlig differentiering af Tu9-celler, men det kan være nødvendigt for at stabilisere eller opretholde TA9-fænotypen og IL-9-sekretionen på senere tidspunkter. Vores resultater af BATF3's rolle i TH9-differentiering er i modsætning til tidligere rapporter om, at BATF3 er uundværlig for Tu1-, TA2- og Tu17-differentiering.2'3'I modsætning til BATF bidrager BATF3 kun til IL-9-sekretion og ikke til andre TH9-cytokiner såsom IL-10 og IL-13, hvilket tyder på, at BATF3 specifikt binder til ll9-promotoren og inducerer IL-9-sekretion. Yderligere undersøgelser er nødvendige for at bestemme yderligere BATF3-målgener under TH9-differentiering og dets rolle i andre Tu-undergrupper.

Klik her for at lære mere om Cistanche

Fig.7 Batf3-mangel fører til reduceret slimhindebetændelse drevet af TH9-TL1A-celler. Naive WTor Batf3-/celler blev differentieret til T_9-TL1A-celler og injiceret i Rag1-7mus. a Repræsentative H&E-farvninger af lunger (toppaneler) og tyktarme (nederste paneler). Målestok: 200 mm. b Histologiscore for lunger.c Samlet celleantal (venstre, midterste), hyppighed af CD4* T-celler (højre). Data repræsenterer middel±SD.n=10/gruppe.d Intracellulær farvning af IL{{11} }, IL-13 og IL-17 fra milt, MLN og lunger efter ex vivo restimulering med PMA plus lonomycin. Data repræsenterer middel±SD.n=5/gruppe. Et repræsentativt eksperiment ud af tre uafhængige eksperimenter er vist.*s<0.05,><0.01 as="" determined="" by="" student's="">

Selvom andre pro-inflammatoriske cytokiner eller mediatorer såsom IL-1, OX40 og TSLP er blevet beskrevet for at forbedreTH9 differentieringTL1A ser ud til at være unik til at opregulere BATF, hvorved kromatin åbnes for rekruttering af andre transkriptionsfaktorer, herunder BATF3.353940 Vores RNA-sekventeringsdata understøtter denne konklusion, der identificerer en undergruppe af BATF-afhængige gener, der er signifikant opreguleret af TL1A. Desuden afslører vores RNA-sekventeringsdata, at BATF3 regulerer aktiviteten af ​​transkriptionsfaktorer, celleproliferation og intracellulær signaltransduktion, hvilket tyder på en vigtig rolle for BATF3 under T#9-differentiering. In vivo resulterede Batf3-'-TA9-TL1A-celler i reduceret slimhindebetændelse og cytokinekspression. Vi observerede ikke nedsat migration af Batf3-'-TH9-TL1A-celler til tarmen, hvilket er i modsætning til BATF-'- CD4 plus T-celler, der ikke opregulerer tarmmigreringsmarkører og ikke befolke tarmene.4' Vores data understøtter BATF3's rolle i den patofysiologiske funktion af TA9-TL1A-celler.

IL-9- og TA9-celler er for nylig blevet forbundet med patogenesen af ​​IBD.*-10 IL-9 plus CD4 plus T-celler blev beriget hos patienter med UC og høje serumniveauer af IL{{ 5}} korreleret med alvorlig sygdom hos patienter med CD.-10I en eksperimentel model for hapten-induceret UC-lignende sygdom, er IL-9-og PU.{10}}mangelfulde mus beskyttet mod tarm inflammation og anti-IL-9 antistoffer er beskyttende i en kronisk forebyggelsesmodel. grad Vi observerede imidlertid ingen virkninger af TL1A på PU.1-ekspression under T9-betingelser. Vi har vist, at TL1A-stimulering resulterer i opregulering af BATF og BATF3, men ikke af PU.1. Selvom PU.1 er blevet beskrevet som en masterregulator for TH9-differentiering, er det kun påkrævet til ekspression af en undergruppe af TH9-gener og mus antyder, at binding af PU.1 ikke ændres i BATF-komplet uafhængighed af PU.1 og BATF. 75

Vi viser, at T,9-TL1A-celler er højpatogene in vivo og inducerer tarm- og lungebetændelse. Tarmbetændelse iTH9-TL1Amodtagerne var hovedsageligt begrænset til tyndtarmen. Desuden observerede vi et øget antal CCR6*- og CD103-celler i TH9-TL1A-modtagere in vivo. Disse data viser konsekvent, at kemokinreceptoren CCR6 og integrinet CD103 udtrykkes på TH9-celler og letter migration til inflammatoriske steder og slimhindeoverflader.15,42 Det øgede antal CCR6 plus-celler i Tμ9-TL1A-recipienter in vivo er i overensstemmelse med vores observation af primært tyndtarmsinflammation, da CCR6/CCL20-aksen har vist sig specifikt at lette migrationen af ​​T,17-celler til tyndtarmen, og det er sandsynligt, at lignende mekanismer gælder for Tμ9-celler.3 Vores resultater er også konsistente med nylige fund af forhøjede IL-9 serumniveauer hos CD-patienter, især med alvorlige sygdomme.?

TL1A forbedrer T,1, TH2 og TA17 differentiering, og selvom vi ikke så nogen indikation på et globalt skift fra T9-celler til andre TH-undergrupper in vitro, kunne det tyde på, at TH9-celler differentieret med TL1A kan være ustabile in vivo og "trans". -differentiere" til andre delmængder. Potentialet for transdifferentiering af TH9-celler har været kontroversielt og kan være afhængig af værtens kontekst, sygdomsmodel og immunstatus. I EAE sker der transdifferentiering af TH9 til IFN-Y-producerende celler, men T,9-fænotypen synes at være stabil i cancermodeller.339 Overraskende nok fortsatte in vivo T9-TL1A-celler med at producere IL{ {18}} og nedstrøms cytokiner såsom IL-17 og IL-13 og transdifferentierede ikke. Denne opfattelse understøttes også af vores data, der viser, at anti-lL-9-behandling alene er tilstrækkelig til at blokere de patogene virkninger af T9-TL1A-celler. Anti-Lil-9 antistofbehandling alene reducerede IL-13-produktionen og svækkede tarm- og lungebetændelse tilbage til TH9-niveauer. Udviklingen af ​​allergisk lungebetændelse kræver sammenlægning af TH2- og TH9-celler. Vores model for kronisk, ikke-allergisk lungebetændelse synes dog hovedsageligt at være drevet af IL-9-producerende T.9-celler, selvom vi ikke kan udelukke et bidrag fra IL-9-producerende ikke-T-celler i patogenesen i vores model.

Sammenfattende er TL1A en stærk inducer af murin og human T9-differentiering, og vi belyste de involverede signalveje. I betragtning af de pro-inflammatoriske egenskaber af TH9-TL1A-celle in vivo, kan målretning af TL1A-BATF3-IL-9-aksen være en lovende terapeutisk tilgang i T19--drevne patologier såsom IBD eller allergisk lungesygdom.

METODER

Mus C57BL/6, C57BL/6 Rag1-/, B6.SJL-Ptprc" Pepc/BoyJ(CD45.1),(B6.Cg-Nfkb1*m130l/J), Stat. 6-/-(B6.129S2(C)-Stat6"miGr"/J), p50-/-B6.Cg-Tg(TcraTcrb)425Cbn/ (OT-I),Batrf/( B6.129s-Batm1.1kmm/) og Bat3-/(B6.129 S(C)-Batf3m1km"/) mus blev købt fra Jackson Laboratory. Dr3-/- n mus er blevet beskrevet andetsteds.4 Mus blev holdt under SPF-betingelser. Alle dyreforsøg blev godkendt af Cedars-Sinai Medical Center Animal Care and Use Committee. T-celleisolering og differentiering Naive T-celler (CD62LhichcD44'o"CD25~; kloner MEL-14, IM7, PC61.5; eBioscience) blev isoleret fra milte og MLN ved hjælp af EasySeptM Mouse CD4 plus Isolation Kit (stamcelle Teknologier) efterfulgt af cellesortering (MoFlo, Beckman Coulter). Celler blev dyrket i RPMI-1640-medium (10 procent FBS) med anti-CD3'er (145-2C11;BD Biosciences), anti-CD28(37.51) ; eBioscience)(TH0-betingelser) og murint TL1A(100 ng/ml; R&D-systemer) under T-9-betingelser (human TGF- 1 [3 ng/ml], Biolegend, IL{{66} } [20ng/ml, PeproTech).Efter 2 dage blev IL-2(20 U/ml) tilsat. For at evaluere celleproliferation blev sorterede celler mærket med carboxyfluoresceinsuccinimidylester (CFSE; Invitrogen), differentieret i 5 dage, og CFSE-fortynding blev vurderet ved flowcytometri. For at evaluere antigenspecifik T,9-differentiering blev naive CD4 plus T-celler fra OT-Il-mus stimuleret i 3 dage med 1 ug/ml OVA;23-339-peptid i tilstedeværelsen af ​​syngene APC'er (forhold 1:3). e fremstillet ved udtømning af CD90.2T-celler fra splenocytter (Stem Cell Technologies) efterfulgt af mitomycin C-behandling. isolering af humane CD4 plus T-celler og differentiering Blod blev opnået fra raske frivillige efter informeret samtykke i overensstemmelse med procedurer etableret af Cedars-Sinai Institutional Review Board (IRB # 3358, 2673). Naive CD4 plus T-celler (CD4 plus CD25-CD45RA plus CD45RO7) blev isoleret fra PBMC ved hjælp af EasySepl Human CD4 T-celleberigelseskit (stamcelleteknologi) efterfulgt af cellesortering. Celler blev dyrket med anti-CD3（5 ug/ml） og anti-CD28（2 ug/ml） med human TL1A (100ng/ml; Fitzgerald) under TH9-betingelser (human TGF- 1 [5 ng/ml] , human IL-4 [10 ng/ml]). ELISA Cytokinkoncentration i kultursupernatanter blev analyseret med ELISA for murin eller human IL-9, IL-10 og IL-13(eBioscience). Intracellulær farvning Celler blev restimuleret med 50 ng/ml PMA(phorbol12-myristat13-acetat), 500ng/ml ionomycin og monensin (eBioscience) i 4 timer, farvet med anti-CD4 (RM{{ 117}},eBioscience),fikseret og permeabiliseret ved hjælp af FoxP3-farvningsbuffersættet (eBioscience) og farvet med antistoffer mod murint IL-9 (RM9A4, BioLegend),IL-10(JES{{123} }E3),IL-13(13A),IL-17A (eBio17B7), IL-17F (eBio18F10),IFN-y(XMG1.2),IL{{136} } (BVD6-24G2),IL-22 (1H8PWSR),Ki67(SolA15),BATF(MBM7C7), IRF4 (3E4),human IL-9(MH9A4, alt eBioscience), og BATF3(841792, R&D Systems). Prøver blev analyseret ved hjælp af et CyAnADP flowcytometer (Dako Cytomation) og FlowJo software (TreeStar Inc.).

Kvantitativ RT-PCR

Total RNA blev isoleret ved hjælp af RNeasy-kits og revers transskriberet til cDNA med Omniscript RT-kit (begge Qiagen). brugt til Actb, I9, I10, 13 og BATF (IDT) (Supplerende tabel 7). RT² SYBR"Green qPCR Mastermix(Qiagen) og primersæt blev brugt til Actb og Batf3 (IDT). mRNA-ekspression af målgener blev normaliseret til ekspressionen af ​​Actb. Den relative genekspression blev beregnet ved metoden.

2-AACt Chromatin immunpræcipitation

Chloe blev udført ved hjælp af EZ ChIP kromatin immunpræcipitationskit (Millipore) efterfulgt af qPCR-analyse. Totalt blev 1×10 graders celler stimuleret, fikseret, sonikeret og immunpræcipiteret ved hjælp af 2 ug af ChIP-grade antistoffer: anti-BATF(sc-100974),anti-BATF3(sc-162246),normal mus lgG(sc-2025), anti-IRF4(sc-6059), normal gede-lgG(sc-2028)(alt Santa Cruz Biotechnology), anti-acetyl-histon H3({{17 }}), og normalt kanin-lgG (Milli-pore). Immunpræcipiteret DNA blev omvendt tværbundet, oprenset under anvendelse af spin-søjler og analyseret ved qPCR (primersekvenser: Supplerende tabel 7). For at kvantificere immunpræcipiteret DNA genererede vi en standardkurve fra serielle fortyndinger af input-DNA. Data præsenteres som procentdelen af ​​input-DNA baseret på normalisering i forhold til mængden af ​​input-DNA.

RNA-sekventering (GEO-adgangsnumre: GSE60362 og GSE106926)

Low-input RNA-Seg (TH9 vs. TH9-TL1A): Clontechs SMARTer Ultra"Low Input RNA Kit til Sequencing v3 blev brugt til at generere dobbeltstrengede cDNA-biblioteker fra 1,5 til 2,5 ng totalt RNA fra hver prøve i henhold til producentens anbefalinger Dobbeltstrengede cDNA-biblioteker blev individuelt fragmenteret og ligeret med lon Torrent lon Xpress" stregkodeadaptere ved hjælp af lon Xpress" Plus Fragment Library Kit med begrænsede modifikationer, herunder størrelsesvalgte endelige biblioteker med en dobbeltperleoprydning og V-volumen af ionadaptere. RNA-Seq biblioteker blev vurderet for koncentration og længde ved hjælp af Invitrogens QubitdsDNA HS Assay Kit og AgilentHigh Sensitivity DNA Kit, respectively. Samples were multiplexed to obtain >10 millioner aflæsninger hver til sekventering. De poolede biblioteker blev amplificeret på lon Sphere" og sekventeret under anvendelse af lon PIM Sequencing 200 Kit v2,lon Torrent".

mRNA-Seg (WT vs.Baft3-7T,9-TL1A): Illumina TruSeq Stranded mRNA library preparation kit was employed for RNA-Seq. Of total RNA, 1 ug per sample was used for poly-A mRNA selection using streptavidin-coated magnetic beads. cDNA was synthesized from enriched and fragmented RNA using reverse transcriptase (Super-Script ll, Invitrogen) and random primers. The cDNA was converted into double-stranded DNA, and enriched with PCR for library preparation. The PCR-amplified library was purified using Agencourt AMPure XP beads(Beckman Coulter). The concentration of the amplified library was measured with a NanoDrop spectrophotometer and on an Agilent 2100 Bioanalyzer. Samples were multiplexed to obtain >20 millioner læsninger/sample og sekventeret på en NextSeq 500-platform (Illumina) ved hjælp af 75-bp single-end sekventering.

Dataanalyse. Rå læsninger blev filtreret og trimmet af FASTX-værktøjssættet (http://hannonlab.cshl.edu/fastx{{0}}toolkit/) og justeret ved hjælp af Tophat version 2.0.8 med UCSC GRCm38/mm10 musereferencegenomannotation (http://genome.ucsc.edu). Genaflæsningstællinger blev genereret ved hjælp af HTSeq (v0.5.4) og derefter normaliseret ved det trimmede gennemsnit af M-værdi-normaliseringsmetoden med edgeR (v3.0.8) i Bioconductor i R(v2.15), som bruger et vægtet trimmet gennemsnit på log udtryksforhold. Til alle analyser blev der kun brugt kvalitetssignaler (tærskel: ti tællinger pr. million i mindst to ud af fire prøver). En uovervåget analyse blev udført ved hjælp af de 100 bedste rangerede gener efter interkvartilområdet, og derefter blev hierarkisk klyngning genereret ved hjælp af (v2.11) ved hjælp af to-vejs Pearson-korrelationer for at visualisere upartiske gennemgående genekspressionsmønstre. Overvåget analyse ved hjælp af en modificeret Fishers eksakte test i edgeR og en falsk opdagelsesrate på 10 procent ved hjælp af Benjamini og Hochberg-proceduren blev brugt til at bestemme differentiale udtryk mellem TH9 og T.9-TL1A eller WT og Batf{{23} }T,9-TL1A. Pathway berigelse analyse blev udført ved hjælp af DAVID6.7 (http://david.abcc.ncifcrf.gov/) med tælle tærskel-gamle =5 og lethed score tærskel=0.05.

T-celle overførselsmodel

CD4 plus CD62LighcD44"cD25- T-celler fra CD45.1-mus blev differentieret til T9- eller T,9-TL1A-celler i 3 dage. Rag-hanmus{{10}}/modtagermus blev injiceret ip med 0,5×10 grader TH9 eller TH9-TL1A-celler. Mus blev vejet i 6-8 uger. Til neutraliseringsforsøg blev mus injiceret ip med anti-IL-9 eller lgG2b kontrol antistof (begge 50 ug/dosis; R&D-systemer) tre gange om ugen i 4 uger og to gange om ugen i den resterende tid, startende på dagen for T-celleoverførsel. Væv blev formalinfikseret, paraffinindlejret og farvet med H&E eller AB-PAS. Inflammation blev scoret af et semikvantitativt scoringssystem af en uddannet patolog, der var blindet for de eksperimentelle forhold.45,46 LPMC blev isoleret fra tyktarmen som tidligere beskrevet.7 Lungevæv blev fordøjet i 45 minutter ved 37 grader C med 10 ml HBSS indeholdende 15 ug/ml Liberase" (Roche) og 25 ug/ml DNase I (Sigma) og filtrering gennem en 40- μm cellesi efterfulgt af lysering af røde blodlegemer. Enkeltcellesuspensioner blev farvet med anti-CD4, anti-CD45.1(A20), anti-CCR6 (29-2L17) og anti-CD103(2E7, alle eBioscience) og anti-Ki{{52 }}(SolA15, BD PharMingen)antistoffer til flowcytometri eller restimuleret med anti-CD3c/anti-CD28-antistoffer i 3 dage. Cytokinniveauer i supernatanter blev målt ved ELISA.

Statistikker

Statistisk signifikans blev beregnet ved hjælp af SPSS-software (IBM SPSS Statistics 20, IBM Machines Corp., Armonk, NY, USA). Data blev analyseret under anvendelse af envejsvariansanalyse (ANOVA) efterfulgt af en post hoc uparret to-halet Student t-test eller Mann-Whitney U-test som angivet. Forskelle blev betragtet som væsentlige på s<>

ANKENDELSER

Dette arbejde blev støttet af NIH (DK056328 til SRT) og F. Widjaja Foundation (SRT og KSM). Anita Vibsig Neutzsky-Wulff modtog postdocstipendier fra Carlsbergfondet (Danmark) og Lundbeckfonden (Danmark). Jordan Nunnelee modtog en Student Research Award fra Crohn's and Colitis Foundation of America. Cedars-Sinai MIRIAD IBD Biobank er støttet af F. Widjaja Foundation Inflammatory Bowel and Immunobiology Research Institute, NIH/NIDDK bevilger P01 DK046763, U01 DK062413 og The Leona M and Harry B Helmsley Charitable Trust.

FORFATTERS BIDRAG

MT,HH,LT,MW,BS,MW,BS,MW,JN,JS, AN-W,RB,YW,JT,VF og KM. udførte eksperimenter analyseret data og kritisk gennemgået manuskriptet. AP, J.T og YW udførte RNA-Seq-dataanalyse. MT, ST og KM designede eksperimenterne. MT og KM skrev manuskriptet.

YDERLIGERE INFORMATION

Onlineversionen af ​​denne artikel (https://doi.org/10.1038/s41385-018-0122-4) indeholder supplerende materiale, som er tilgængeligt for autoriserede brugere.

Konkurrerende interesser: Forfatterne erklærer ingen konkurrerende interesser.

Udgiverens note: Springer Nature forbliver neutral med hensyn til jurisdiktionskrav i offentliggjorte kort og institutionelle tilknytninger.

REFERENCER

1. Dardalhon, V. et al. IL-4 hæmmer TGF-beta-inducerede Foxp3 plus T-celler og sammen

med TGF-beta, genererer IL-9 plus IL-10 plus Foxp3(-) effektor T-celler. Nat. Immunol. 9, 1347-1355(2008).

2. Veldhoen, M. et al. Transformering af vækstfaktor-beta "omprogrammerer" de forskellige-

initiering af T-hjælper 2-celler og fremmer en interleukin 9-producerende undergruppe. Nat. Immunol.9, 1341-1346 (2008).

3. Jager, A, Dardalhon, V, Sobel, RA, Bettelli, E. & Kuchroo, VK Th1, Th17 og Th9

effektorceller inducerer eksperimentel autoimmun encephalomyelitis med forskellige patologiske fænotyper.J.Immunol.183,7169-7177(2009).

4. Licona-Limon, P. et al. Th9-celler driver værtsimmunitet mod gastrointestinal

ormeinfektion. Immunity 39,744-757(2013).

5. Purwar, R. et al. Robust tumorimmunitet mod melanom medieret af interleukin-9-

producerer T-celler. Nat. Med. 18, 1248-1253 (2012).

6. Gerlach, K. et al. TH9-celler, der udtrykker transkriptionsfaktoren PU.1, driver T-celle-

medieret colitis via IL-9-receptorsignalering i tarmepitelceller. Nat Immunol.15,676-686(2014).

7. Nalleweg, N. et al. IL-9 og dets receptor er overvejende involveret i

patogenese af UC. Gut.64,743-755 (2015).

8. Feng, T. et al. Serum interleukin 9 niveauer forudsiger sygdommens sværhedsgrad og den kliniske

virkningen af ​​infliximab hos patienter med Crohns sygdom. Inflamm. Tarm Dis. 23, 1817-1824(2017).

9. Matusiewicz, M., Neubauer, K, Bednarz-Misa, I, Gorska, S. & Krzystek-Korpacka, M.

Systemisk interleukin-9 ved inflammatorisk tarmsygdom: sammenhæng med slimhindeheling ved colitis ulcerosa. World J. Gastroenterol. 23,4039-4046(2017).

10. Tiltalte, C. et al. Betydningen af ​​serum II-9-niveauer i inflammatorisk tarm

sygdom. Int. J. Immunopathol. Pharmacol. 28, 569-575 (2015).

11. Jash, A. et al. Nuklear faktor af aktiverede T-celler 1(NFAT1)-induceret permissive

kromatinmodifikation letter nuklear faktor-kappaB (NF-kappaB)-medieret interleukin-9 (IL-9) transaktivering. J. Biol. Chem. 287,15445-15457(2012). 12. Staudt, V. et al. Interferon-regulatorisk faktor 4 er afgørende for udviklingen

program af T-hjælper 9 celler. Immunity 33, 192-202 (2010).

13. Goswami, R. et al. STAT6-afhængig regulering af Th9-udvikling.J. Immunol.

188,968-975(2012).

14. Chang, HC et al. Transskriptionsfaktoren PU.1 er nødvendig for udvikling af

IL-9-producerer T-celler og allergisk inflammation. Nat. Immunol. 11, 527-534 (2010).

15. Jabeen, R. et al. Th9-celleudvikling kræver en BATF-reguleret transkriptionel

netværk. J. Clin. Investere. 123,4641-4653(2013).

16. Kaplan, MH Transkriptionsfaktornetværket i Th9-celler. Semin. Immunopathol.

39,11-20(2017).

17. Echlin, DR, Tae, HJ, Mitin, N. & Taparowsky, EJB-ATF fungerer som negativ

regulator af AP-1-medieret transkription og blokerer cellulær transformation af Ras og Fos. Oncogene 19,1752-1763 (2000).

18. Murphy, TL, Tussiwand, R. & Murphy, KM Specificitet gennem samarbejde:

BATF-IRF-interaktioner kontrollerer immunregulerende netværk. Nat. Rev. Immunol. 13,499-509(2013).

19. Sopel, N., Graser, A., Mousset, S. & Finotto, S. Transskriptionsfaktoren BATF

modulerer cytokin-medierede responser i T-celler. Cytokin Growth Factor Rev. 30,39-45 (2016).

20. Edelson, BT et al. Perifere CD103(plus) dendritiske celler danner en samlet undergruppe

udviklingsmæssigt relateret til CD8 alfa(plus) konventionelle dendritiske celler.J. Exp. Med. 207,823-836(2010).

21. Hildner, K. et al. Batf3-mangel afslører en kritisk rolle for CD8alpha＋ dendritisk

celler i cytotoksisk T-celle-immunitet. Science 322,1097-1100 (2008).

22. Meylan, F. et al. TNF-familiereceptoren DR3 er essentiel for forskellige T-celle-

medierede inflammatoriske sygdomme. Immunity 29, 79-89 (2008).

23. Fang, L, Adkins, B, Deyev, V. & Podack, ER TNF-receptorens væsentlige rolle

superfamilie 25 (TNFRSF25) i udviklingen af ​​allergisk lungebetændelse. J. Exp.Med.205,1037-1048(2008).

24. Pappu, BP et al. TL1A-DR3-interaktion regulerer Th17-cellefunktionen og Th17-

medieret autoimmun sygdom. J. Exp. Med. 205,1049-1062 (2008).

25. Bull, MJ et al. Dødsreceptoren 3-TNF-lignende protein 1A-pathway driver

ugunstig knoglepatologi ved inflammatorisk arthritis.J. Exp.Med. 205,2457-2464 (2008).

26. Thomas, LS et al. TNF-familiemedlemmet TL1A inducerer IL-22-sekretion i

begåede humane Th17-celler via IL-9-induktion. J. Leukoc. Biol. 101,727-737 (2017).

27. Richard, AC et al. TNF-familieliganden TL1A og dens receptor DR3 fremmer T

cellemedieret allergisk immunopatologi ved at øge differentiering og patogenicitet af IL-9-producerende T-celler.J.Immunol.194,3567-3582(2015). 28. Tan, C. et al. Antigen-specifikke Th9-celler udviser unikhed i deres kinetik af

cytokinproduktion og kort retention på det inflammatoriske sted. Immunol. 185,6795-6801(2010).

29. Wilhelm, C. et al. En IL-9 skæbnerapportør demonstrerer induktionen af ​​en medfødt IL-

9 respons ved lungebetændelse. Nat. Immunol. 12, 1071-1077 (2011).

30. Banias, G. et al. Rolle af TL1A og dets receptor DR3 i to modeller af kronisk

murin ileitis. Proc. Natl Acad. Sci. USA 103, 841-8446 (2006).

31. Betz, BC et al. BATF koordinerer flere aspekter af B- og T-cellefunktion påkrævet

for normale antistofresponser.J. Exp.Med. 207,933-942(2010).

32. Schraml, BU et al. AP-1 transkriptionsfaktoren BATF kontrollerer T(H)17

indvielse. Nature 460, 405-409 (2009).

33. Glasmacher, E. et al. Et genomisk regulatorisk element, der styrer samling og

funktion af immunspecifikke AP-1-IRF-komplekser. Science 338,975-980 (2012). 34. Li, P. et al. BATF-JUN er afgørende for IRF4-medieret transkription i T-celler. Natur

490,543-546(2012).

35. Yao, W. et al. Interleukin-9 er påkrævet til medieret af allergisk luftvejsinflammation

af cytokinet TSLP.Immunity 38,360-372 (2013).

36. Ciofani, M. et al. Et valideret regulatorisk netværk for Th17-cellespecifikation. Celle

151,289-303(2012).

37. Tussiwand, R. et al. Kompensatorisk dendritisk celleudvikling medieret af BATF-

IRF interaktioner. Nature 490, 502-507(2012).

38. Iwata, A. et al. Kvaliteten af ​​TCR-signalering bestemt af differentielle affiniteter af

forstærkere til det sammensatte BATF-IRF4 transkriptionsfaktorkompleks. Nat. Immunol.18,563-572(2017).

39. Vegan, F. et al. Transkriptionsfaktoren IRF1 dikterer den IL-21-afhængige

anticancerfunktioner af TH9-celler. Nat. Immunol. 15,758-766(2014).

40. Xiao, X. et al. OX40-signalering favoriserer induktion af T(H)9-celler og luftveje

betændelse. Nat. Immunol. 13, 981-990 (2012).

41. Wang, C. et al. BATF er påkrævet for normal ekspression af gut-homing

receptorer af T-hjælperceller som reaktion på retinsyre. J. Exp. Med. 210, 475-489(2013).

42. Kara, EE et al. Distinkte kemokinreceptorakser regulerer Th9-cellehandel

over for allergiske og autoimmune inflammatoriske steder. J. Immunol. 191,110-117 (2013).

43. Esplugues, E. et al. Kontrol af TH17-celler sker i tyndtarmen. Natur 475,

514-518(2011).

44. Shih, DQ et al. Inhibering af en ny fibrogen faktor Tella reverserer etableret

colon fibrose. Mucosal Immunol.7,1492-1503 (2014).

45. Ostanin, DV et al. T-celleoverførselsmodel for kronisk colitis: begreber, overvejelser og tricks. Er. J. Physiol. Mave-tarm. Lever Physiol. 296, G135-G146(2009).

46. ​​Chin, JE et al. Luftvejsrekruttering af leukocytter i mus er afhængig af alfa4-

integriner og vaskulært celleadhæsionsmolekyle-1. Er. J. Physiol. 272, L219-L29 (1997).

47. Weigmann, B. et al. Isolering og efterfølgende analyse af murine lamina propria

mononukleære celler fra tyktarmsvæv. Nat. Protoc. 2, 2307-2311 (2007).